手把手全流程教你0基础掌握宏基因组高级生信分析,宝藏课程!

学术   2024-11-25 12:05   上海  

生科云网址:https://www.bioincloud.tech

01
课程简介
为助力科研,深圳微科盟现推出高级生信培训班(代码实现)的系列课程,内容涵盖宏基因组、代谢组、扩增子、转录组、单细胞转录组、蛋白质组、基因组等多个组学。
今天要免费分享的是宏基因组高级生信培训系列课程,此系列课程旨在帮助科研人员零基础掌握宏基因组研究的全流程。课程内容全面,涵盖从课题设计到数据分析的各个环节,包括:

1.宏基因组研究概括和课题设计

2.宏基因组分析步骤和结果解读

3.原始数据的处理方法代码实现:如测序数据质控、物种注释、功能注释

4.常规分析手段代码实现:如丰度可视化、差异比较、多样性分析

5. 高级分析技术代码实现:包括多组学关联分析、富集分析、通路图绘制等

6. 论文图片编辑技巧:如发表级图片编辑(svg编辑器的使用)

本系列课程采用循序渐进、由浅入深的保姆式教学方式,帮助科研人员逐步深入学习如何挖掘宏基因组数据的生物学内涵。通过系统学习,学员将能够独立进行个性化的数据分析,不再依赖他人,实现科研能力的大幅提升。

请联系微科盟组学老师限时免费获取视频课程以及代码资料等,微科盟组学老师联系方式见后文,课程具体内容如下

课程序号主题课程内容主讲人
1基础农学宏基因组学研究概况及课题方案设计王呈瑞
2医学宏基因组学研究概况及课题方案设计孟令超
3宏基因组分析步骤和结果张锦
4linux环境(WSL)搭建与linux shell基础,conda张国兴
5测序原始数据处理张国兴
6R语言安装与R语言基础张国兴
7丰度可视化百分比堆积柱形图代码实现张国兴
8分组聚类热图代码实现张国兴
9显著性差异比较ANOVA/Kruskal Wallis/LEfSe实战张国兴
10多重比较实战张国兴
11DESeq2火山图实战张国兴
12相关性分析&多组学关联相关性热图代码实现储陈辰
13相关性网络代码实现储陈辰
14RDA/CCA代码实现储陈辰
15回归分析代码实现储陈辰
16多样性分析PCA/PCoA代码实现张国兴
17NMDS和PERMANOVA代码实现张国兴
18α多样性分析代码实现张国兴
19拓展富集分析代码实现张国兴
20通路图代码实现张国兴
21图片编辑发表级图片编辑(svg编辑器的使用)张国兴


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讲师简介

1.王呈瑞中国海洋大学硕士。现任深圳微科盟科技集团有限公司组学老师6年宏基因组,转录组代谢组微生物全基因组比较分析等多组学分析行业经验。

2.孟令超,南京农业大学硕士。现任深圳微科盟科技集团有限公司组学顾问,5年宏基因组、转录组、代谢组、蛋白质组以及基因组等多组学分析研究行业经验。

3.张锦,华南理工大学本科,中国科学院硕士。现任深圳微科盟科技集团有限公司组学顾问,7年宏基因组、转录组、代谢组等多组学分析行业经验。

4.张国兴, 2018年研究生毕业于中国农业大学, 此后一直在深圳微科盟科技集团有限公司工作,任微科盟数字副总,负责生科云(生物信息数据分析平台,注册用户 2.5 万人+)的架构全栈开发,系生科云总工程师。拥有8年的组学生信分析经验,熟悉生物信息学领域的各种分析方法和数据库,并且可以熟练使用大数据云计算相关手段对生物信息学大数据进行分析,此外还熟悉计算机相关知识原理,掌握人工智能相关算法。亲自撰写的代码20万行+,前期的生信视频课程观看人次累积超过20万+,而且以一作的身份发表过组学方向的二区的SCI论文。

5.储陈辰,2023年研究生毕业于南京林业大学,从事生物信息学方向,毕业之后入职深圳微科盟科技集团有限公司。任职生信工程师,负责开发生科云(生物信息数据分析平台,注册用户2.5万人+)组学数据分析云流程和云工具,参与多组学关联分析云流程以及多个生信分析云工具的开发工作。熟悉应用python、R、shell语言


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观看方式

视频课程以及讲座资料请联系微科盟组学老师获取,已添加微科盟组学老师的请直接联系已添加的组学老师领取,如果您没有添加过微科盟组学老师,请添加多组学老师4,请勿重复添加。

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17338106701


课程内容节选如下:

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