22号染色体是人类的23对染色体之一。在正常的人类体细胞中,会有1对22号染色体,一条来自父亲,一条来自母亲。一条22号染色体有 50,818,468 bp (GRCh38),约占人类细胞DNA总长度的 1.5-2.0%,有 417 个基因(CCDS)。
1999年,在人类基因组计划中,22号染色体是第一个被完全测序的人类染色体。在染色体核型分析中,人类的染色体按其表观大小进行编号,1号染色体是最大的,22号染色体最初被认为是最小的。然而,基因组测序显示,21号染色体实际上比22号染色体要小。
染色体(chromosome)来自希腊语 χρῶμα(色度,“颜色”)和 σῶμα(体细胞,“体”),描述了它们对特定染料的强染色。染色体是遗传物质,是基因的载体,人类的常染色体是成对存在的。人体的体细胞染色体数目为23对,其中22对为男女所共有,称为常染色体(autosome);另外一对为决定性别的染色体,男女不同,称为性染色体(sex chromosome),男性为XY,女性为XX。
当细胞不分裂时,染色体在细胞核中是不可见的——在显微镜下也是如此。然而,构成染色体的 DNA 在细胞分裂过程中变得更紧密,染色体在显微镜下可见,此时我们可以通过显微镜观察染色体的数量和结构,来判断染色体是否正常。
染色体(chromosome)是细胞分裂时DNA 存在的特定形式,DNA 被一种称为组蛋白的蛋白质紧密卷绕并被包装成一个线状结构。
上图为显微镜下观察到的染色体
上图为染色体模式图
染色体整体的不同部位对颜料的着色能力不同,表现出颜色深浅不一,所以通过显微镜可以观察到每条染色体不同区域的深浅条带,这是区分23条不同染色体的基础。
22号染色体
相关疾病
22号染色体三体
trisomy 22 (T22)
由于22-三体多引起早期的流产,因此产前的病例也非常少见。根据包括美国梅奥诊所在内的4个中心对2010~2015年期间的9例22-三体胎儿的回顾性研究中发现,羊水过少是最常见的超声表现,在55%的患病胎儿中可观察到。其次是颈项透明层厚度(nuchal translucency, NT)增厚及胎儿生长受限(fetal growth restriction, FGR)。此外还可出现心脏畸形、泌尿生殖系统异常、马蹄内翻足、胸腔积液等。
所有已报道的22-三体综合征临床表型汇总如下∶小头畸形(microcephaly)、耳部异常(abnormal ears)、颈蹼(webbed neck)、心脏异常(cardiac ab-normalities)、指长(long fingers)、肾缺如、肾脏发育不良(absent kidney, kidney dysplasia)、生长迟缓(growth delay)、唇腭裂(cleft palate/lip)、智力障碍(mental retardation)、鼻梁扁平(flat nasal bridge)、尿道下裂(hypospadias)、肛门狭窄(anal stenosis)、小指内弯(clinodactyly of fifth fingers)、指(趾)甲异常(abnormalfinger/toenails)、发绀(cyanosis)、耳前凹陷/皮赘(preauricular pits/tags)、耳前瘘(preauricular sinus)、肛门闭锁/直肠异常(imperforate anus/rectal abnormalities)、血管畸形(vascular malformations)、胃肠道畸形(gastro-intestinal malformations)、癫痫发作(seizures)、肌张力低下(hypotonia)。其中最常见的为鼻梁扁平、耳廓异常、小头畸形、先天性心脏病、泌尿生殖器异常及生长限制,这些表型在许多常染色体三体综合征中都可出现,并且由于活产胎儿病例太少,较难进行表型偏好性的统计。
嵌合型22-三体综合征的临床表现和嵌合的比例有关,存活者可表现为不同程度的智力障碍、特殊面容、听力丧失、卵巢衰竭、并指、偏侧萎缩以及条纹状色素沉着等。22号染色体三体嵌合病人的青春期发育及生育率,仍需积累大量数据。
Woods等(1994)报道了2例嵌合型22-三体女性患者有双侧条索状性腺并且无法进入正常的青春期发育
Wertelecki等(1986)报道1例嵌合型22-三体卵巢发育不良。
目前报道的存活的病例30余例,虽然嵌合型22-三体的大多数患者有认知障碍,但也有认知正常的报道。
Luisa等(2005)报道1例智力正常的5岁女童,其皮肤成纤维细胞染色体证实嵌合体临床诊断∶47,XX,+22/46,XX。身体右侧的活检显示 25%的核分裂中有22-三体;左侧有32%的嵌合比例,在其5岁左右的评估中,她的智商被确定为105(韦氏儿童智力量表-第四版)。有3名嵌合型22-三体综合征患者评估智商得分在55~80。
2010年,Leclerc等报道了一例羊水及皮肤核型均为22号染色体三体嵌合、外周血核型为46,XX的病人,其产前超声并无明显异常,出生后也无发育迟缓,4岁时智力及发育正常,提示22号染色体三体嵌合病人的智力发育具有差异性,这可能与染色体三体嵌合部位及比例有关。
Dalal等(2013)总结了21例患者的细胞遗传学结果,发现只有30%的患者是外周血嵌合型22-三体,89%的患者皮肤成纤维细胞为嵌合型22-三体,即单纯的外周血核型检测可能对诊断嵌合型22-三体不够全面,需要结合其他组织进行核型分析。
再发风险评估及遗传咨询
在多数情况下,22-三体的发生为生殖细胞减数分裂过程中的随机新发事件,复发的风险不高。如果22-三体中存在22号染色体与近端着丝粒染色体13、14、15、21、22形成的罗伯逊易位,这有可能父母一方是罗伯逊易位的携带者,因此父母也需进行染色体检测,以明确染色体异常的来源。对于有22号染色体及其他近端着丝粒染色体非同源罗伯逊易位携带的夫妻,自然试孕的流产风险较高,可建议通过尝试辅助生殖技术(assisted reproductive technology, ART)及胚胎植入前基因检测(preimplantation genetic testing,PGT)排除异常胚胎,获得健康的后代。
22号染色体单亲二体
单亲异二体(heterodisomy,hetero-UPD):两条染色体来自同一亲本的两条同源染色体。
单亲同二体(isodisomy,iso-UPD):两条染色体来自同一亲本的同一染色体。
复合型单亲二体(mix-UPD):部分表现为单亲同二体,部分表现为单亲异二体。
片段性单亲二体(seg-UPD):染色体的一部分表现为UPD。
父源性和母源性UPD(22)临床上少见,大多数母源性UPD都始于减数分裂异常导致三体自救而产生,大部分与母亲年龄增加有关,多数情况下它与UPD(13)、UPD(21)一样临床表型正常,除非合并三体嵌合体。
母源性UPD(22)合并22-三体嵌合病例:JM de Pater等(1997)报道1例22三体嵌合病例。胎儿出现原因不明的严重宫内生长受限和室间隔缺损。在妊娠37周绒毛膜绒毛取样(chorionicvel-lussampling, CVS)发现所有细胞系的核型都为47,XX,+22。同时在取自羊水的培养细胞中,只有十分之二的克隆是22-三体。足月分娩后,患儿表现为发育迟缓、轻度畸形(心脏室缺、小下颌、耳前凹点)。淋巴细胞呈核型正常的46,XX[50]核型;22号染色体均为母源性单亲二体。使用荧光原位杂交法对胎盘分娩后的调查显示,在14个位点活检中仅有1个22三体细胞。在培养的皮肤成纤维细胞中,观察到嵌合47,XX,+22[7]/46,XX[25]。患儿临床随访最长19个月。该病例的临床表现是由三体细胞的存在而引起的,而不是由母源性UPD引起的。
再发风险评估及遗传咨询
据评估,在新生儿中,UPD发生频率为1:2,000。最常出现在1号、4号、16号、21号、22号和X染色体;普通人群中母源UPD发生率为父源UPD的3倍。疑似遗传疾病人群中,UPD发生率约为2:1,000 (0.2%)。已报道的UPD病例在 6、7、11、14 和 15 号染色体上最常见。由于UPD来源于父/母一方,若父/母22号染色体存在隐性遗传病致病基因突变,则可能导致相应疾病的发生。因此无论父源性还是母源性UPD(22),患者通常临床表型正常。临床表现异常时应考虑是否合并低比例22-三体嵌合体,或母源性及父源性UPD(22)导致的隐性遗传疾病基因纯合性突变致病。故认为孤立性的UPD(22)患者预后良好。
Ring chromosome 22
46,r(22)
Weleber 等于1968年首次报道r(22),目前全球已报道近百例。r(22)通常是在胚胎发育早期由染色体末端断裂并重新融合而成,在此过程中伴随有遗传物质的丢失。
r(22)患者的临床表型主要有生长发育迟缓、语言发育缺失或迟缓、小头畸形、肌张力低下、面容畸形、自闭症等;此外还可能有上呼吸道感染、淋巴水肿、癫痫、心脏异常、肾脏和泌尿生殖系统问题、斜视等。
Mahajan等(2012)总结了17例r(22)患者的临床表现,如下表
少数受累个体可无明显异常表型(仅表现为原发性不孕不育、NF2风险增加)。
Zuccarello等(2010)总结了15例表现正常的r(12)携带者,如下表:
Liou等(2014)总结了6例产前为r(16)的胎儿,如下表:
1994年,Nesslinger等首次报道SHANK3基因。SHANK3基因定位于22q13. 33,编码突触后密度结构蛋白,该基因突变或基因剂量的改变均可引起神经发育系统异常。目前已报道的由于SHANK3基因缺失而致病的患者有150多例,这些患者均有共同的表型,包括精神发育迟滞、严重的语言发育落后、肌张力低下、行为异常等。
22q13.3缺失综合征
Phelan-McDermid 综合征(PMS)(MIM#606232)也称22q13.3缺失综合征,是22号染色体长臂末端缺失导致的罕见遗传性疾病, 是神经发育障碍性疾病,显性遗传,发病率无明显性别差异。
Ravnan等(2006)对11 688例发育障碍患者亚端粒重排的研究,发现22q13是仅次于1p36的第二常见亚端粒重排区。
1985年,Watt等首次报道了1名14岁PMS男患儿,其临床表现为语言缺失、轻微畸形特征,严重智力障碍,被认为是母源22号染色体臂间倒位使得减数分裂重组,导致22q12至22q末端缺失。
至今有超过1500例PMS患者,约0.5-2%的自闭症和智力障碍为PMS患者。国外研究认为94%的PMS患者具有孤独症谱系障碍,75%PMS有严重的智力障碍。
语言发育迟缓是PMS最为常见的症状,几乎所有的PMS患者均存在语言发育障碍,表达性语言比接受性语言受到的影响更大,且语言交流能力存在差异。部分患者无法说话,一些患者可以说简单的单词,部分患者可以用简单的句子交流,这种差异可能和缺失的大小有关。
新生儿肌张力降低是首个出现的临床症状,会导致新生儿哭泣无力、头部控制不良、喂养困难、反射减退(觅食反射、吞咽反射、握持反射、拥抱反射、吮吸反射)及运动里程碑延迟(翻滚、爬行、行走)等;肌张力降低可能在儿童和成人时期持续存在,粗大和精细运动协调能力受影响的程度因部位和严重程度而异,但是患者的步态几乎均会受到影响,包括跨阈步态、足趾着地行走导致步态不稳等,甚至无法行走。肌张力降低和神经功能缺损可能导致PMS患者被误诊为脑瘫,肌张力降低可能和更大的缺失相关。
对PMS患者的长期随访提示,随着年龄的增长,语言发育迟缓、自闭症、癫痫等症状会逐渐出现并呈缓慢加重,但其行走等运动能力及部分特征如大而丰满的手、肌张力低下等则会逐渐改善。
罗举语等(2022)总结了41例PMS患者,如下表,其临床表现广泛,神经系统表现包括发育迟缓、智力障碍、言语缺失或发育落后、癫痫、皮肤过热或变红、出汗减少、对触摸过度敏感、痛觉减退、蛛网膜囊肿、低肌张力减退、步态异常、孤独症谱系障碍、睡眠障碍、发育倒退等;畸形特征主要有小头症(头小畸形)、巨头症、稀疏眉毛、长睫毛、眼距过宽、宽鼻梁、蒜头鼻、耳畸形(耳大)等;其他表现为胃食管反流、腹泻或便秘、生殖器异常、湿疹、免疫缺陷、反复上呼吸道感染、听力损失、先天性心脏缺陷、肾功能障碍、哮喘等。
在文献中,有6项研究报道了PMS患者有大脑结构异常,平均发生率为25% (58/233),如小脑蚓部发育不全,胼胝体薄,脑白质异常等。Tabet等(2017)研究中,23例有脑结构异常(65.7%)。
PMS的主效基因于2001年被Bonaglia等阐明,其剂量敏感的特征也进而被证实。22q13缺失可分为末端型、中间型和其他罕见类型。
75%的患者为单纯性22q13区的末端或中间缺失,末端缺失大多数(约73%, Sarasua et al 2014)发生在父源性22号染色体。
引起PMS的22q13.3缺失片段大小长短不一,短缺失可小于100kb,最长可延伸至大于9Mb。染色体片段缺失包括简单缺失(~70%)、不平衡易位、环状染色体形成(~7%)或涉及其他22号染色体结构重排等。几乎所有的缺失片段都涉及SHANK3基因,绝大多数缺失为新发的。
基因型与表型研究表明,涉及SHANK3基因缺失的表型外显率几乎100%,染色体片段缺失的大小与临床表现多样性和/或严重程度呈正相关,如与新生儿低肌张力、发育迟缓、畸形特征、言语能力、孤独症相关的社交障。此外,末端缺失较小的患者可能比缺失较大的患者发育更好有研究表明,缺失所包含的额外基因也有助于表型表达。但是,不同文献之间基因型与表型研究结果仍未达成共识。
近年来,随着大规模的测序技术的发展及应用,SHANK3基因点突变引起的PMS患者不断被检测出来。在Nevado等(2022)研究中,大多数为微缺失(189/210,90%),21例为SHANK3基因变异(10%)。
研究发现,由点突变引起的SHANK3单倍剂量不足以导致一系列与PMS相关的症状,且与片段缺失的患儿相比,SHANK3点突变患儿言语障碍和运动障碍更轻,提示其他基因缺失也参与了PMS的病因学。
已有文献报道,淋巴水肿只存在于大于10岁且缺失大于4.3Mb的患者中,提示淋巴水肿可能与年龄相关。
罗继航等(2018)报道两例22q13区域分别出现69kb和587kb的杂合缺失,认为患儿临床表现与缺失片段的长度相关,大片段的缺失涉及多个致病基因,常与明显的结构畸形和更为严重的临床表型相关;小片段的缺失通常为末端的小缺失,其临床表现包括严重的认知障碍、语言和交流障碍、肌张力低下等。
SHANK3基因
SHANK3基因是SHANK突触骨架蛋白家族的一员,长度约59 kb,包含 22个外显子,富含GC序列(GC含量69%),主要编码位于兴奋性突触上的支架蛋白(scaffolding protein)。在大脑中,SHANK3蛋白主要表达在兴奋性神经元的突触后致密区(postsynaptic density, PSD),是参与构成PSD复合体的主要成分,PSD对于谷氨酸受体功能的调节和突触可塑性有重要意义。
SHANK3编码蛋白与神经生长素共同参与了突触后结构的构建,尤其是与社交、语言相关的突触结构通路,进而导致突触功能异常和神经网络异常。单一拷贝的SHANK3可以导致语言和社交障碍。多项研究表明,SHANK3 的单倍剂量不足是22q13缺失综合征的重要病因。
22q13重复
单纯性22q13重复相当罕见,目前仅20余例报道。
Magri等(2015)总结了10例2q13重复患者,共同的临床表型有精神发育迟缓、身材矮小、小头畸形、异常面容等。如下表:
Johannessen等(2019)总结了28例2q13重复患者,共同的临床表型有智力障碍、轻度畸形特征,发育迟缓,行为问题,癫痫、注意力缺陷多动障碍(ADHD)、双相情感障碍,精神分裂症、ASD,如下表。