据我了解，是经验。是基于微生物学研究中的经验，一代代的实验积累得出的结论，目的就是减少由于长期传代导致的菌种退化或变异，确保研究和生产中使用的菌种具有稳定的遗传特性和生物活性。这篇文章介绍了相关内容，可以阅读一下。
Reference Strains How many passages are too many.pdf
众所周知，传代次数越多变异率越高，并没人说5代以上的菌种就不能使用，而是，越容易出现问题。如果5代以上菌种形态结构、生理生化性状等均未发生变化，还是可以使用的。但，在实验过程中，并不建议过多传代。（难听话，明知不可为而为之，自讨苦吃。）
1代是指将活的培养物接种到微生物生长的新鲜培养基中培养，任何形式的转种均被认为是传代1次。必要时，实验室应对工作菌株的特性和纯度进行确认。
5.菌种如何保藏？
在药典中9203药品微生物实验室质量管理指导原则中的规定如下：建议采用低温冷冻干燥、液氮贮存、超低温冷冻（低于-30℃)等方法保存。低于-70℃或低温冷冻干燥方法可以延长菌种保存时间。标准储备菌株可用于制备每月或每周1次转种的工作菌株。冷冻菌种一旦解冻转种制备工作菌株后，不得重新冷冻和再次使用。也可参照微生物菌种保藏与活化技术指南：收藏必备手册相关内容。
5.实际操作中，如何确认是哪一代菌种？
部分实验室对菌种管理严格，而一部分实验估计乱成一锅粥了。实验的学生或职工一拨又一拨，菌种之间来回穿梭，早就不知道那代菌种，如何鉴定菌种代数？
这种情况本身就经常存在，那我们只能以接受到菌种的那一代作为0代。接到菌种后，简单地进行形态学鉴定和生理生化特性检测菌株活力。如果没有问题的话，这就是F0，母代菌种。但有一点一定清楚，它确实不是药典中规定的0代菌种。（不标准，只供参考。）
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