1908年11月10日傍晚5点钟左右。光绪皇帝在囚禁处显现出中毒的症状。
当晚，光绪的服侍人员向内务府发出了两道紧急召医的手谕，但是内务府带来的医生于当天夜里均被阻拦在中南海宫门外，未能进入瀛台为光绪帝诊治。
次日早晨，西医屈桂庭进入瀛台，发现光绪帝腹痛难忍在床上打滚，且“面黑，舌黄黑”，并断言此症状“与前病绝少关系”。
但是屈桂庭也未对此时中毒垂危的光绪帝进行任何救治，仅仅进言“以暖水熨敷腹部”便匆匆退出。
1908年11月14日晚6时33分左右，光绪帝因病暴毙而亡。
1908年11月15日17点，慈禧也在仪鸾殿因病去世。
据记载，在光绪帝尚未发病时，慈禧太后就已经命人将皇帝的梓宫（棺材）提前停在了乾清宫，预备替其发丧。这也是为什么怀疑是慈禧毒杀了光绪的原因。
因为只有她才有权力安排皇帝的棺材，别的人干这事，那简直是找死。
岂不料，光绪皇帝在中毒后仍然坚持了四天没死，这也让慈禧又多熬了四天，估计她就是要看着光绪咽气后，才肯自己也咽气。
至于慈禧为什么要毒杀光绪（如果确定是由慈禧所杀），我觉得有四个原因：
第一，慈禧与光绪的关系早已破裂，两人之间势同水火。
戊戌变法时，慈禧听说光绪打算派兵包围颐和园，甚至还要杀自己。结果慈禧大怒，不仅废了新法，还软禁了光绪。当然了，这一切其实根本不是光绪的本意，他也没有那么狠心。但从此以后，两人的关系破裂，始终无法愈合。
戊戌政变之后，慈禧打算废掉光绪，改立大阿哥溥儁为新君。如果这事慈禧办成了，光绪可能当年就死了。因为这涉及到了皇位问题，逊位的皇帝不能留！可以猜测，慈禧那个时候就起了杀光绪的心思。
只不过当时各国的大使纷纷反对，才逼迫这一改立新君的事件终止。后来慈禧还恼火洋人的态度，重用端郡王那种小人，导致义和团运动失控，最终引发了惨绝人寰的八国联军侵华事件。
第二，紧接上一点。慈禧恨洋人，而洋人却支持光绪。
相比于慈禧，洋人确实是比较喜欢开明的光绪帝。西方各国大使不止一次公开声明，只承认光绪帝是清国的统治者。并谴责慈禧以太后的身份一直干政。而慈禧最恨别人说她干政。因此也进一步讨厌光绪。
后来八国联军退兵之后，慈禧就跟哈巴狗一样极力讨好洋人。而这些事，是她之前都不屑于干的。不过为了稳住洋人，继续让洋人认可的光绪皇帝当傀儡。她只能勉为其难了，但是她的内心肯定很恼火。责怪这都是光绪给他惹的祸！
直到2008年，为了揭开光绪皇帝的死因之谜，国家清史编纂委员会联合清西陵文物管理处和北京市公安局法医检验鉴定中心等单位联合组成“清光绪帝死因”专题研究课题组，通过对光绪遗体的头发、遗骨、衣服及墓内外环境样品，进行反复检测研究和分析后，发现光绪的衣领及头发上均沾染有高浓度的三氧化二砷（砒霜）。由于尸体腐败时的体液浸蚀，从而导致其衣服及头发都沾有砒霜，而且总含量已高达201毫克。
一般人服用60~200毫克的砒霜就会导致死亡，因此光绪的死因可以确定为“急性肠胃型砒霜中毒”而死。
第二件是杀慈安太后。
咸丰去世之后将象征皇权的“御赏印”赐给慈安，让她和八位辅臣一起辅佐幼帝；凡事必须盖上“御赏印”和幼帝持有的“同道堂印”方能生效；可见咸丰看中的是慈安以及八位辅臣，对他们寄予厚望。这让慈禧很嫉妒。不过，说咸丰给了慈安一道旨意，说可以弄死慈禧，这是空穴来风。
慈禧工于心计，咸丰必然没看出她是具有狼子野心的人，因为辜负了慈禧，咸丰内心也不是没有一丝愧疚的，基于这两点原因，咸丰也不可能下这么一道奇怪的旨意。
咸丰死后，两个寡妇共同抚养幼子，慈安内心对慈禧是很同情的，而慈禧对慈安的智慧和胸襟也颇为认同，据记载，两人一度相处融洽。后来慈禧杀八大臣，收回权力，也是慈安默许的，慈安并没有野心。但是慈安的死也颇为蹊跷，历史学家认为，慈禧是幕后黑手。
注：1、袁世凯因向慈禧泄密“光绪要杀慈禧”（因为慈禧阻碍光绪帝改革），导致光绪先被囚，后被毒死；
2、珍妃是光绪帝最宠爱的妃子，自然也逃不过。
