脑影像工具包| BASCO(BetA-Series COrrelation)介绍
文摘
科学
2024-11-11 17:48
浙江
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BASCO（BetA-Series COrrelation）是一种用于研究事件相关fMRI数据区域间功能连接并评估实验条件对功能连接调节的软件工具。该方法基于一般线性模型（GLM），其中每个试次中的诱发活动由单独的协变量建模。（1）基于种子点的功能连接分析：利用定义的种子区域对其平均beta序列进行估算区域的平均beta序列，并与大脑中每个体素的beta序列相关联；
（2）基于ROI的网络分析：给定一个大脑区域，例如基于SPM AAL模板，提取每个ROI的平均beta序列，并计算出与所有 ROI 相关的网络矩阵；
（3）基于体素的全脑网络分析：一个体素的度被定义为与大脑中其他体素的连接数，这些连接数强于定义的绝对阈值。体素度是功能连接性改变的灵敏标记功能连接性改变的敏感标记，具有很高的空间分辨率。
BSACO是基于SPM和MarsBaR并在Matlab环境下运行的软件包。（1）下载并安装SPM8或SPM12和 MarsBaR；（2）确保已将SPM和MarsBaR添加到Matlab路径（不包含子文件夹）并且两个工具箱都能正常工作。运行SPM和MarsBaR并检查是否有错误信息；（4）解压文件，需要使用Matlab命令“unzip ”；（5）将BASCO文件夹添加到 MATLAB 路径中（不包含子文件夹）；（6）下载教程数据。将数据解压缩到BASCO文件夹中；（7）工具箱提供的一些分析脚本会调用脑连接工具箱中实现的功能，请从https://sites.google.com/site/bctnet获取。
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编译：富柄淇
校正：展琳琳
