微生物的名字到底咋写?

学术   教育   2024-04-29 11:43   北京  
阅读和撰写论文/文章时,必然会碰到微生物拉丁名的撰写,生物的分类单元包括界门纲目科属种,种是最基本的分类单位,株是一种微生物的不同来源的纯培养物,菌的名字通常用属+种+株的写作方式,但你真的写对了吗?本文分享微生物名称的写法,以供参考。
  1. 微生物如何命名?

按国际命名法命名,即Linna所创立的“双名法”。拉丁学名= 属名+种名加词+定名人+时间。例如:
  • 大肠埃希氏菌“大肠杆菌”:Escherichia coli (Migula) Castellani et Chalmers 1919
  • 当然,我们一般都简化处理,即属名+种名+株名(命名人自由取个名字就可以,这也是做微生物研究的乐趣之一),例如我们曾从大连海事大学校园土壤里筛选到一株食醚红球菌,就可以命名为Rhodococcus aetherivorans DMU1。
2. 属种株要不要斜体?
属:首字母大写,斜体
种:小写,斜体
株:正体
  • 如果没有鉴定到种,或是未知种,则在属名后用sp.(单数时)或spp.(复数时)表示,sp.是种species的缩写,spp.是种的复数species的缩写。注意,sp.和spp.表示种时,正体,例如:Rhodococcus sp. DMU1。
  • 有时候,我们会看到亚种的出现,亚种一般用subsp.表示,正体。
  • 此外,当一篇论文中某个菌出现多次,第一次出现用全称,后续则可以将菌属缩写,一般取首字母+点,当然也得斜体奥,例如R. aetherivorans DMU1。

3. 新的种属如何命名?

  • 新属:gen. nov., sp. nov.
  • 新种:sp. nov.
  • nov.是拉丁文novum的缩写,上述写作时都是正体,放在菌株种属名的后面以表示是新的种属。一般来说,只需在第一次发表文章时进行标注。发表新的微生物的权威期刊主要是International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology。例如任南琪老师曾在哈尔滨筛选到一株新的产氢细菌,命名哈尔滨产乙醇杆菌,则写作:Ethanoligenens harbinense gen. nov., sp. nov.

4. T代表啥意思

有时候读文献的时候,我们看到菌株的株名上面有个T的上标,例如Ethanoligenens harbinense JCM 12961TT上标为type strain,表示的是保藏于JCM菌种保藏库里编号为12961的菌,且为模式菌。

5. 除了属之外其他的分类单元需要斜体吗?

首先属以上的分类单元撰写时,首字母要大写,至于斜体不斜体,目前貌似没有统一明确的答案。
我们看看教科书上的案例。在外文教材《Brock Biology of Microorganisms》,微生物的界门纲目科属种菌用斜体表示(下图),不仅如此,域Bacteria, Archaea Eukarya都用斜体撰写。我国周德庆老师的《微生物学教程》和沈萍/陈向东老师的《微生物学》均采用的正体写法。不同的期刊要求也不尽相同,一般而言,一些SCI期刊要求斜体为多,例如International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology上其他分类单位为斜体,而一些中文期刊要求使用正体。
那么,怎么办呢?如无特殊说明,建议写斜体,若投稿指南中有明确说明,以投稿指南为准。
为什么要斜体呢?主要原因是由于微生物的科学名称是拉丁形式,它们遵循古典拉丁语、中世纪拉丁语或现代拉丁语语法,因此属和种的名称通常以斜体印刷(或在手稿中下划线表示斜体字体)以表示尊重。对于更高的分类单元,不仅仅是中国特殊,其他国家惯例也各不相同:在英国,通常用普通的罗马字体,但在美国,他们通常用斜体。
来源:Brock Biology of Microorganisms

所以,你学废了吗



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