第三届 | 11.23-11.27 | 白质信号分析实训 | 杭州

文摘   科学   2024-11-11 17:48   浙江  

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主办单位

杭州脑海科技有限公司

脑海科技认知神经科学实验室

承办单位

杭州脑呈科技有限公司


















1. 课程简介


目前白质的研究多用于弥散张量成像技术(DTI)探究白质结构异常,虽然这些方法可以揭示白质结构的精细细节,但它们不能为其功能提供直接的证据。最近的研究表明,白质表现出与灰质类似的依赖于血氧水平的信号波动。研究结果表明,与灰质类似,白质表现出一种内在的功能组织,可以使用磁共振成像来研究。白质功能信号的研究可能会为认知神经科学和临床神经精神病学的研究开辟新的途径。但就数据分析技术方面,针对白质功能信号处理大多需要写代码编程,加大了白质课题研究的难度为回馈广大医生及脑科学研究者,并助力大家迅速掌握静息态白质功能信号处理的相关知识,本次课程特别设计,旨在帮助每位学员快速具备独立进行数据分析的能力。采用课程+答疑的教学方式,确保每位学员都能够轻松上手。

课程亮点包括

白质代码讲解:为解决白质功能信号处理暂无成熟开源软件的问题,课程将详细讲解如何运行代码进行白质课题研究,帮助学员快速掌握白质数据分析。包含白质区域内的局部指标分析白质功能网络的聚类分析白质随机节点的分析灰白质协变连接分析等。

已发表案例详解:精选多角度的已发表研究案例,深入剖析实际应用中的分析方法和技术要点,帮助学员了解前沿进展,并启发创新思维。

绘图技巧精讲:教授专业绘图技巧,提升数据可视化水平,让您的研究成果更加生动、直观,易于传播。

通过本次课程的学习,您将不仅能够掌握扎实的理论知识,还能在实战演练中提升技能,为您的科研之路增添强大的动力。无论您是初学者还是有一定经验的研究人员,我们都将为您提供最贴心、最有效的指导和支持,让您在静息态功能磁共振研究领域迅速成长!选择我们,开启一段精彩纷呈的学习旅程吧!

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2.学习内容

白质功能信号分析:

(1)白质功能信号相关研究进展概述

白质结构与功能研究方法与意义介绍

白质功能信号计算局部指标文献讲解

白质功能脑网络研究方法解析

(2)白质功能信号计算局部指标方法

白质功能信号预处理讲解与计算

制作个体空间白质mask与组水平白质mask

基于白质功能信号计算低频振幅指标

(3)基于白质功能信号指标的统计分析与多重比较校正

基于白质功能像信号指标的统计分析

多重比较校正讲解与操作

白质功能信号指标的结果呈现

白质功能信号指标差异脑区的图表制作与结果汇报

基于差异脑区的对白质功能信号指标值提取

(4)白质功能脑网络创建

制作个体空间白质mask与组水平白质mask

去除皮层下组织区域

白质区域划分方法讲解与操作

构建白质功能连接矩阵

(5)白质聚类分析

(6)矩阵水平的统计分析与多重比较校正

基于白质脑网络连接进行:单样本T检验、双样本T检验讲解与操作

多重比较校正讲解与操作

白质差异脑区的图表制作与结果汇报

基于差异脑区的对白质功能信号指标值提取

(7)基于白质网络的有向连接

 白质区域数据预处理

 白质聚类分析

 基于白质网络的格兰杰因果分析

 结果可视化:有向环形图的制作

(8)灰白质协变网络分析

 功能像数据预处理

 灰质网络创建

 白质网络创建

 灰质网络连接分析

 白质网络连接分析

 灰白质网络协变分析

(9)白质脑网络动态分析
 文献方法部分解读
数据预处理

白质网络创建

白质网络静态功能连接分析

白质网络动态功能连接分析

动态连接聚类分析

白质状态间的时间参数表征分析

(10)白质功能连接密度分析

文献方法部分解读

数据预处理

白质区域提取

BRANT工具包介绍

基于白质的局部FCD指标计算

基于白质的全局FCD指标计算

统计分析与多重比较校正

结果可视化

3.白质功能信号的SCI应用案例


静息态功能磁共振研究之所以能够产出大量的研究成果,其中一个关键原因在于,通过对多批次数据集应用不同的研究思路与方法,可以衍生出多样化的研究课题。由此可见,分析思路对于课题的成功至关重要。本课程将涵盖多个已发表成果的实际案例讲解,帮助您掌握多样化的分析方法。


(1)白质聚类网络结合格兰杰因果分析已发表SCI案例讲解+手把手解决操作问题+课程答疑

课程关键词 白质功能网络、聚类分析、网络间有向连接、格兰杰因果分析

课程主要内容

案例探讨了患者白质功能网络与健康对照之间的相互作用。方法采用K-means聚类算法识别出白质功能网络,通过系数格兰杰因果分析检验网络层面的相互作用。


(2)多频段灰白质网络协变分析已发表SCI案例讲解+手把手解决操作问题+课程答疑

课程关键词: 灰质网络分析、白质网络分析、灰白质网络协变分析、频段特异性分析

课程主要内容: 

案例采用功能协方差连通性(FCC)来估计两个白质网络之间的协变关系,基于它们与多个灰质区域的相关性。FC是两个区域BOLD信号的相关性,因此只能反映两个有限区域的信息(即一对一的信息流)。相比之下,FCC通过整合来自多个地区的信息,进行复杂的信息交互(即一多对一信息流)。


(3)白质随机节点动态功能连接分析已发表SCI案例讲解+手把手解决操作问题+课程答疑

课程关键词 白质随机节点网络构建、白质功能连接分析、灰质功能连接分析、动态功能连接分析、聚类分析

课程主要内容:

案例全面表征整个大脑的时空组织对于理解人类大脑的功能和功能障碍至关重要。灰质静息状态功能连接(FC)有助于揭示大脑固有的基线网络。然而,几乎占大脑一半的白质在这种表征中被很大程度上忽略了,案例探讨了灰白质脑区在静态与动态连接中是否存在患者与对照组的差异,结果表明白质BOLD信号的动态特征与灰质信号相似,具有丰富的时间动态特征信息。


(4)白质局部FCD与全局FCD分析已发表SCI案例讲解+手把手解决操作问题+课程答疑

课程关键词: 白质功能信号分析、local-FCD、global-FCD

课程主要内容:

功能连接密度(FCD)方法作为一种无偏方法,能够测量每个体素的功能连通性(FC),从而可以识别局部和全局连接模式。案例将该方法应用于患者与对照组的白质区域展开相关研究。


4.脑影像绘图(多工具)


基础绘图

在SCI论文中,图表的美化不仅是视觉上的提升,更是对研究结果的有效传达和专业展现。美观的图表可以帮助读者更快速地理解数据和研究结果,美观的图表能够吸引读者的注意力,增加论文的可读性和吸引力,高质量的图表反映了作者对研究工作的认真态度,提升了论文的整体专业形象。

课程关键词:MRICRON、RESTplus、BrainNet、GRETNA、GraphPad等


进阶绘图

R 语言作为一种强大的统计计算和图形生成工具,在数据可视化方面有着诸多优势。R 语言提供的绘图库(如 ggplot2, lattice, ggvis, plotly 等)允许用户高度定制图表的各个方面,包括颜色、字体、轴标签、图例等。


注:基础绘图与进阶绘图课程(原价1500/人),现限时免费赠送:成功报名白质功能信号分析实训后,免费赠送基础绘图与进阶绘图课程

以上课程均支持培训期间反复观看

5. 脑海科技相关介绍


脑海科技核心团队组建于2018年,公司位于萧山区紫橙国际创新中心3号楼6层及10层,是一家专注于脑影像相关的科研平台研发、技术培训、数据分析技术服务及脑科学相关设备销售的科技型公司,已被认定为“国家级高新技术企业”、“国家级科技型中小企业”、“浙江省创新型中小企业”及“浙江省科技型中小企业”,入选杭州市萧山区高层次人才创业创新“5213”领航类项目,并通过ISO9001质量管理体系认证,并经杭州市科协审批建立了“博士创新站”。

2021年脑海科技成立了下属的研究实验室(脑海科技认知神经科学实验室)专注于神经影像相关的学术工作,脑海实验室目前已累积联合培养硕士研究生41名、博士研究生12名。截止目前,实验室成员累积发表SCI文章85篇,其中JCR一区SCI文章28篇,JCR二区SCI文章41篇。实验室研究团队有着丰富的脑影像研究经验,目前已有近百余名研究生或医生的联合培养或短期访学的合作经验,联合培养了很多优秀的研究生,如:高*艳以主要作者发表SCI文章5篇、郝*奇以主要作者发表SCI文章6篇、李*婷以主要作者发表SCI文章6篇、孙*伟以主要作者发表SCI文章4篇、王*以主要作者发表SCI文章3篇、展*琳以主要作者发表SCI文章3篇等等(鉴于篇幅所限,仅列举部分同学)。学习中心核心团队具有丰富的SCI文章审稿经验,担任50余个SCI杂志审稿人,包括:Alzheimer's Research & Therapy、Molecular Autism、IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics、NeuroImage、BMC Psychiatry、Human Brain Mapping、Translational Stroke Research、CNS Neuroscience & Therapeutics、Journal of Affective Disorders、Autism Research等等。

贾熙泽,博士,杭州脑海科技有限公司创始人、浙江师范大学心理学院特聘教授、主要研究方向为静息态功能磁共振方法学及焦虑障碍的神经机制。自2013年起,师从臧玉峰教授从事静息态功能磁共振方法学研究,RESTplus软件包的开发人,负责REST-meta-PD 国际多中心项目。现兼任山东第二医科大学附属医院特聘专家、大连市友谊医院特聘教授、常熟市第二人民医院磁共振脑成像研究中心副主任、山东第二医科大学医学影像学院硕士生导师及佳木斯大学信息电子技术学院硕士生导师等。现为中国心理学会积极心理学专委会委员、浙江省数理医学学会放射学专委会委员、浙江省康复医学会神经调控专委会委员,主持国自然青年基金项目1项、入选杭州市青年科技人才培育工程项目,目前以主要作者在Science Bulletin、 Human Brain Mapping、 The Journal of Headache and Pain 及 Journal of Affective Disorders 等杂志发表文章 30 余篇(第一作者或通讯作者),文章被 SCI 杂志引用1057次,h-index =16,担任 40余个SCI杂志的审稿人。


6.报名及费用说明


(1)学习内容白质信号分析实训

(2)学习模式:学习规划 + 导师制 + 小组答疑(5人以内)+  体系化视频课程 + 定期进度跟进 + 学习效果评估 + 完整案例数据

(3)硬件资源每名学员配备2台电脑,1台用于观看学习视频,1台用于分析数据(Intel i7或以上配置)

(4)学习周期5天

(5)答疑方式:每天下午固定16点进行小组答疑,数据分析遇到报错,助教随时响应并协助解决问题

(6)学习费用

2024年11月23日-11月27日期间到场学习,可享受优惠价3100元/原价4500元/人),转发朋友圈,集赞超过28个,立减200元(即2900元/人

注 交通及食宿费用自理

7. 报名流程及付款方式

报名可扫描以下二维码添加樊衍孜微信联系报名(扫描以下二维码或添加微信号:19906719439)

可开具能够报销的正式发票(如:技术服务费及培训费等)。支持预存,可以现场刷公务卡或银行卡转账,学习期间谢绝录像及录音。

电话咨询:0571-2883 4398(请按3号键)

微信咨询:199 0671 9439

邮箱咨询:fanyanzi@brainimaging.cn

实验室地址:浙江省杭州市萧山区城厢街道金城路39号紫橙国际创新中心3号楼6楼602室


8.FAQ

Q:课程具体是什么形式?
A:脑海科技团队录制了完整的讲课视频,并且整理了相应的数据分析工具、代码以及技术文档,报名的学员会有一份学习规划,可根据学习规划观看对应教学视频。操作问题助教随时响应,理论以及科研问题每天下午16:00进行小组答疑(5人以内)


Q:与传统培训班相比,学习效果怎么样?

A:远比传统培训班学习效果好, 1)学习时间集中且充足,每天包括9小时的学习时间(9:00 ~ 18:00),方便请假和安排时间。2)答疑及时,操作问题可以随时响应,解决问题效率高。 3)视频课程经过反复设计和打磨,可以根据自己的进度灵活调整,由浅入深,不怕跟不上。4)有导师定期跟进进度,确保能够跟上。目前来访的学员都可以掌握相应的技术,并且满意度都很高。


Q:价格及优惠活动

A:我们会推出在固定时间段内的优惠价格,具体以当期通知为准,在此基础上,可参加朋友圈集赞等优惠活动。

9.更多学习方案欢迎详询


以下学习方案现已开启,火热报名中!敬请关注“脑海科技学习中心”公众号:

实训 第二届 | 11.15-11.19 | 结构像数据分析实训 | 杭州(点击跳转至链接)
实训 | 第一届 | 11.15-11.19 | 静息态数据分析基础实训 | 杭州(点击跳转至链接)
一对一 大脑白质功能信号数据分析基础培训 | 随到随学(点击跳转至链接)
一对一 静息态数据分析基础培训 | 随到随学(点击跳转至链接)
一对一 | 磁共振结构数据分析(VBM)基础培训 | 随到随学(点击跳转至链接)
一对一 | 弥散张量成像(DTI)数据分析基础培训 | 随到随学(点击跳转至链接)
一对一 | 基于结构协变网络的格兰杰因果分析(CaSCN) | 随到随学(点击跳转至链接)
一对一 独立成分分析与网络间连接(ICA+FNC)基础训练 | 随到随学(点击跳转至链接)
一对一 基于大脑皮层分析基础训练 | 随到随学(点击跳转至链接)
一对一 共波动分析(Cofluctuation analysis) | 随到随学(点击跳转至链接)
一对一 | 脑影像元分析(META)基础培训 | 随到随学(点击跳转至链接)
一对一 | 基于机器学习的脑影像数据分析基础培训 | 随到随学(点击跳转至链接)
一对一 基于结构协变网络的网络攻击分析、模块化与拓扑属性(GAT)| 随到随学(点击跳转至链接)
一对一 | 基于滑动时间窗的动态分析基础培训 | 随到随学(点击跳转至链接)
如有其他想要学习的内容,欢迎添加樊衍孜的微信反馈(微信号:19906719439),我们将研发新的学习方案。





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