“药食同源”潜力无限,1个月拿捏2区毕业神刊,审稿飞快!贵州中医药大学:成分测定+网络药理学+分子对接,超简单思路爱了爱了!

文摘   2024-11-25 10:00   上海  


秋冬进补期到了,朋友们开始补起来了吗?
咱们进补会常用到一些药食同源的食物,比如枸杞、大枣、葛根、天麻、黄芪、石斛等等,其实药食同源不仅在养生圈广受追捧,作为科研方向最近也很火哦,搭乘“中医药”的快速列车,发文那是嗖嗖的~
馆长今天就带来一个超级简单的文章,药食同源方向,网药+一点实验就能发2区4.9分,关键还能快速发文,1个月就接受,这不是妥妥的毕业党刚需期刊嘛!不过这个期刊是IJMS(International Journal of Molecular Sciences),MDPI旗下杂志,审稿很快,录用难度低,如果单位/学校已经限制此刊,那就忽略,没限制的话毕业发文就用它!
这篇文章选择的是药食同源的中药“天麻”,天麻的研究多在神经系统疾病中,糖尿病中研究较少,有研究的必要性和临床意义,同时也满足创新性要求。另外,文章思路设计为成分鉴定+生物活性检测+网药+分子对接,比同IF水平的文章要简单很多,也很容易复现(换个药食同源的中药,选个研究少的疾病,直接就能复制一篇,拿去毕业爽歪歪),除了药食同源选题的创新性外,杂志的选择也是一个重要原因,需要快速发文毕业的中医药小伙伴,可以尝试下~
网药老套路不好发文了?别担心,馆长团队给你提供新思路,只要跟紧我的每日推荐,思路的事就迎刃而解啦!什么?看到新思路不知道怎么复现?直接联系馆长啊,咱们团队个性化思路设计、生信分析都能做,十年经验,包满意的哟~ 

定制生信分析

云服务器租赁

加好友备注“99”领取试用

题目:应用高效液相色谱、生物活性、网络药理学和分子对接技术研究天麻治疗二型糖尿病的药效成分
杂志:IJMS(IF=4.9)
发表日期:2024年9月

研究背景
二型糖尿病 (T2DM)是一种世界性的慢性疾病,其发生主要是由胰岛素分泌不足引起的,并且给卫生系统带来了巨大的负担。天麻(GE)是一种药食同源的食品,据报道具有抑制糖苷酶活性的能力,表明其在治疗糖尿病方面的潜力。然而,用于治疗T2DM的GE的主要药理学成分尚未完全阐明。
研究思路
该研究首先利用高效液相色谱法测定GE中标志成分的含量,然后检测GE的抗氧化活性和α-葡萄糖苷酶抑制活性。接下来,从SwissTargetPrediction数据库收集6种GE标志成分的靶点,然后从OMIM和GeneCards数据库中收集T2DM相关靶点,与GE成分靶点取交集,获得共同靶点,利用PPI网络筛选关键靶标,对关键靶点进行KEGG和GO富集分析,建立成分—靶点—疾病网络。最后应用分子对接方法验证了GE的6个主要成分与前6个蛋白途径靶基因相互作用的可靠性。    
主要结果
1. 高效液相色谱法测定GE中标志成分的含量
该研究利用HPLC测定了GE中6种标志成分(GAS、HBA、Parishin E、Parishin B、Parishin C、Parishin A)的含量,并分析不同干燥方法对成分含量的影响。结果发现,在相同干燥方式下,GE仿野生栽培(DFW/DJW)的6种指标成分总量高于袋装栽培(DFB/DJB)。通过蒸汽冷冻干燥(SFD)方法处理的GE样品具有六种标记成分的最高总含量(表3,表4)。
表3:不同干燥方法中GE的标志成分含量
表4:GE样品的干燥方法
2. 生物活性分析
为了评价GE的抗氧化活性,测定了经7种不同干燥方法处理的一批GE样品对DPPH、ABTS和·OH的清除能力。GE样品的三个抗氧化能力测试显示出在浓度范围内的显著剂量依赖性,蒸汽冷冻干燥的GE对DPPH、ABTS和OH的清除更好,干燥和晒干的GE的结果相似(表5)。随后分析提取物和GE主要成分的α-糖苷酶抑制活性,结果显示,DFW-6的GE提取物的α-糖苷酶抑制能力最强,其次是DFW-3,最差的抑制活性属于DFW-2的提取物。单体化合物中抑制α-糖苷酶能力最强的是parishin C、HBA和parishin B(表6)。    
表5:抗氧化活性
表6:α-糖苷酶抑制活性
3. 网络药理学分析的分子对接
从SwissTargetPrediction数据库收集到6种GE标志成分的320个靶点,然后从OMIM和GeneCards数据库中收集到15336个T2DM相关靶点,与GE成分靶点取交集,获得285个共同靶点(图1)。构建PPI网络,包含53个靶点,从中筛选出12个关键靶标(图2)。对53个靶点进行KEGG和GO富集分析(图3),建立包含GE的6个组分、53个重要靶标和T2DM相关的前10个信号通路的成分—靶点—疾病网络(图4)。应用分子对接方法验证了GE的6个主要成分与前6个蛋白途径靶基因相互作用的可靠性,结果显示parishin A、parishin B、parishin C和parishin E可以同时与多种蛋白质稳定结合,结合能越低,亲和力越好,结构越稳定(图5)。    
图1:共有靶点的鉴定
图2:PPI网络构建    
图3:KEGG和GO富集分析
图4:成分—靶点—疾病网络    
图5:分子对接
小结
这篇文章内容非常简单吧?药食同源方向的选择有一定的创新性,开头的成分鉴定和不同干燥方法的比较做的比较细致,也是一个亮点,反而活性测试实验和网药分析部分非常简单,非常容易模仿复现,做中药方向的朋友不妨试试这个方法,性价比很高!另外,IJMS这个杂志也可以关注一下,还是很适合毕业投稿的。想要在中医药领域追求创新思路的朋友,建议紧跟馆长脚步,生信热点日更不停!想做个性化生信分析?欢迎随时联系馆长!专业团队为你保驾护航,1V1定制创新思路~

馆长有话说

馆长会持续为大家带来最新生信思路,也可以提供特色数据库构建、免费思路评估、付费生信分析和方案设计以及实验项目实施等服务,对数据库构建和生信分析感兴趣的朋友可以咨询馆长哦!

生信分析

方案设计

服务器租赁

孟德尔随机化

网络药理学

单细胞测序

临床公共数据库分析

往期推荐

1.“药食同源”药蓄势待发!武汉理工团队:创新逆向思维,网药+分子对接,3个月速成一区TOP!

2.6分+纯生信!单细胞竟如此吃香!海南大学团队又一佳作,升级版思路基础和临床都适用!快看过来啦~

3.网药分析整新活,中医药SCI迎来大爆发!速看贵中医团队6分+新作:网药+分子对接+湿实验,轻松拿下一区SCI!

生信图书馆
深入解读最新生信文献,分享研究思路和方法,提供专业生信分析服务,帮助您把握生物信息学的最新动态
 最新文章