完犊子了!pubmed停更了?公共数据挖掘到头了?

学术   2024-11-13 13:26   上海  

欢迎来到科研热点频道!鳄梨察觉到PubMed停止更新后,就马不停蹄帮大家找方法,怎样才能用好PubMed“平替”,继续跟紧最新文献更新?如何面对这次变动?鳄梨爆肝长文向你解析!


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Q1 不是第一次“停更”了,两次停更一样吗

Q2 影响自己的文章发表吗

Q3 替代的检索方法都有什么?

Q4 最省心的方向在哪里?


 Q1 

两次停更一样吗?


这次停更,和上次不太一样


2018年1月22日,PubMed官网在搜索栏下方明文表示停止更新,并且表示恢复时间由政府资助恢复时间来定。原来,停摆原因在于预算拨款案没有通过,暂时处于缺少拨款的状态。


而我们检索发现的这一次停更,没有提示


来看一条停止更新的证据:

截图时间:11/12 16:53

官网显示的最新著述,BMC Cancer有4篇,以下是这4篇的PubMed更新时间:

而在同一时间检索期刊官网,得到的结果如图:

BMC Med得到相似的结果,与网络来源的其他情报交叉比对得知,停更的日期锁定在2024年11月7日,正是特朗普宣布胜选之后


不过,特朗普胜选,或者2月28日拜登签署的行政命令“防止有关国家获取美国人的大量敏感个人数据和美国政府相关数据”,恐怕都不是这次PubMed停更的直接原因:10月29日美国司法部(DOJ)发布拟议规则制定通知(NPRM),这也意味着公开数据获取的限制从号召正式走向执行



在敏感数据方面,NPRM将禁止和限制范围限定为:


超过 100 名美国人的人类基因组数据或可从中提取此类数据的生物样本;

超过 1000 名美国人的生物识别信息

超过1000 个美国设备的精确地理位置数据;

超过10,000 名美国人的个人健康数据

超过 10,000 名美国人的个人财务数据;

超过 100,000 名美国人的受保护个人识别信息。


停止更新不妨碍我们正常检索既有的文献。然而,涉及到数据获取和文献发表的问题,比检索不便重要得多。


 Q2 

影响文章发表吗?


别忘了,PubMed不只是PubMed


美国国家生物技术信息中心(NCBI)是PubMed和GEO数据库的联系之一,受美国国家卫生研究所(NIH)管理。涉及人类基因组等信息,它们势必受到拟议规则NPRM影响。数据检索受限可能延展到数据上传/下载受限,对于需要提交GEO登录号的文章,就会面临发表困难的问题。同时,PubMed作为医学药学领域科研成果主要传播途径之一,停止更新也会导致新成果的传播范围受限,进而国际影响力受到影响。


目前GEO数据库还在正常更新,没有受到7日时间节点的影响。


不过也不要认为,PubMed就是一切。


PubMed属于检索工具,不承担文章发表的功能,也不负责SCIE期刊收录。打个比方,PubMed就像一条从小镇进城的捷径,捷径暂时走不通了,小镇也还是小镇,城市还是城市,两者之间仍然有路可走。所以,正在或者即将进入投稿流程的各位小伙伴,按原计划继续即可


选刊投稿有问题

同审稿人打交道太紧张

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 Q3 

替代的检索方法?


对部分期刊重点关注的小伙伴,可以先直接关注期刊官网,进行邮箱订阅


或者,通过Web of ScienceScienceDirect等数据库检索。


鳄梨为大家推荐一些生信友好的期刊,可以在本公众号内搜索期刊名查看相关生信文章拆解及复现,跟着大部队学习,自力更生也能发SCI!


Journal of Translational Medicine

https://translational-medicine.biomedcentral.com/


Frontiers in Immunology

https://www.frontiersin.org/journals/immunology


International Immunopharmacology

https://www.sciencedirect.com/journal/international-immunopharmacology


Phytomedicine

https://www.sciencedirect.com/journal/phytomedicine


Cardiovascular Diabetology

biomedcentral.com/


eClinicalMedicine

https://www.thelancet.com/journals/eclinm/home


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 Q4 

最省心的方法?


俗话说,上下同欲者胜,同舟共济者兴。社群化地学习、沟通,共同进步、情报互通,是应对变化的最好方法。


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