图1 转录组技术发展历程
空间转录组技术主要分为四类，包括微解剖基因表达技术、原位杂交技术，原位测序技术和基于空间条形码芯片的原位捕获技术。
图2 激光捕获显微解剖测序(LCM-seq)
（二）原位杂交技术：通过设计特定RNA序列的荧光探针，实现对特定基因的原位检测。早期的技术，例如单分子荧光原位杂交技术（smFISH），能够实现对单个RNA分子的高分辨率成像，检测RNA分子在细胞中的定位和表达。随着技术的发展，科学家们通过荧光探针多轮杂交对不同种类RNA分子进行颜色编码，可以同时检测到几百乃至上千种基因的表达。代表技术是荧光原位杂交(FISH)及其衍生技术如顺序荧光原位杂交（seqFISH）、多重容错性荧光原位杂交技术（MERFISH）（图3）。此类技术具有很高的分辨率（~200 nm），但需要预先选择感兴趣的基因，预先设计探针，或者选择特定的panel来进行检测。
（三）原位测序技术：通过挂锁探针来靶向已知基因，可以对组织切片内原位进行测序。代表技术有STARmap，其使用条形码挂锁探针与靶标杂交，利用滚环扩增对信号进行放大，并通过杂交引物，经过数轮测序来对不同RNA的条形码进行测序、解码，实现了超过1000种mRNA的同时检测。与原位杂交技术类似，此技术也具有超高分辨率，但也需要预先设计探针或选择panel进行检测。
a. 基于DNA打印技术的微阵列空间条形码，代表技术有10X Visium，其将冷冻组织切片放置在RNA靶向的捕获探针的阵列上，将组织固定后透化以释放RNA，使其与相邻的捕获探针结合，从而捕获基因表达信息。然后从捕获的RNA合成cDNA并测序，最终获得可视化数据。此技术受限于DNA打印的精度，分辨率在100 μm。
图5 基于原位捕获芯片的空间组学代表技术
A) Visium平台芯片；B）基于微流控芯片的DBiT-seq技术；C) 基于DNA寡核苷酸修饰微球芯片的slide-seq技术；D）基于二代测序芯片的stereo-seq技术。
图6 赛陆医疗空间组学技术SalusSTS
空间组学技术在灵敏度、检测通量、分辨率等方面不断取得突破。除了空间转录组学，空间蛋白组学、代谢组学、表观遗传组学等技术也不断涌现和发展，空间多组学联合分析更是生命科学领域的重要趋势。赛陆医疗将不断深耕空间组学领域，拓展空间组学技术和相关应用，为广大科研工作者提供最前沿的技术手段。
关于赛陆医疗
赛陆医疗创办于2020年，是国家高新技术企业和国家专精特新小巨人企业，专注于开发自主知识产权的上游测序平台，并基于其上构建了全球领先的超分辨空间组学平台，实现基因组学和空间组学产品的自主开发及科研临床端转化。公司突破了以往测序和组学产品在通量、成本、分辨率、自动化等方面的瓶颈，取得欧盟CE-IVDR等多项关键认证。公司发展迅速，现拥有国际领先的测序和组学平台，可以为中下游应用提供全面的解决方案，产品畅销海内外。
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