微生物信息哪里找？
学术
2024-11-08 09:43
北京
推荐一个网站：LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (https://lpsn.dsmz.de/)。只要输入微生物的名称，该菌的信息纷沓而来。以嗜吡啶红球菌为例，Rhodococcus pyridinivorans为2000年确定的种，网站提供模式菌信息、菌株发表文章和日期、与其他种关系等等信息。1. 国际菌种保藏机构。例如点击DSM 4455可转到德国国家菌种保藏中心关于该模式菌的信息，了解其来源、培养条件、形貌以及购买信息等。2.BacDive (The Bacterial Diversity Metadatabase)，即细菌多样性元数据库，世界上最大的标准化细菌信息数据库。该数据提供关于该菌丰富的信息，例如形态、培养和生长条件、生理和代谢、生物安全信息、序列信息。此外，还提供了另外一个很有意思的链接：Microbeatlas网站，即该菌株 (相似性大于99%)在全球各环境中的分布信息。例如Rhodococcus pyridinivorans DSM 44555菌株在全球11721个样品中检测到，包括2874水样、4842土样、3364动物样本和641植物样本。3.TYGS：Type (strain) Genome Server，基于基因组比对的分类网站。TYGS基因组服务器提供了一个真正的基于基因组的原核菌株的分类和鉴定。
