怎么都跑不对的PCR终于有救了!!

学术   2024-11-01 14:01   江苏  

PCR实验是一个坑,埋了好多的医僧……

😰三天一小败,五天一大败

真想知道:凭啥我数据出不来???

原因全在这




01


扩不出目的条带:

模板


1️⃣长期放置,反复冻融:模板断裂或者降解,建议使用新鲜制备的DNA模板,并进行琼脂糖凝胶电泳检测
2️⃣模板GC含量过高:DNA双链无法打开,建议更换可用于扩增高GC含量模板的酶及相应的Buffer。
3️⃣模板中含有杂质或者抑制物,特别是甲醛固定及石蜡包埋的组织中常含有甲酸,导致DNA脱嘌呤。建议降低模板浓度。

4️⃣如果模板是cDNA,需确认逆转录所用的RNA的纯度,完整度。


引物


1️⃣引物设计不合理:引物特异性不好,无法结合到模板上或者结合到模板其他位置
2️⃣引物降解:储存条件不当而导致降解




02


非特异性条带:

1️⃣引物特异性差:引物与模板发生非特异性或者引物之间形成二聚体。建议重新设计引物

2️⃣模板不纯、降解或者过量:模板中污染了其他质粒;模板的完整性和纯度不够。
3️⃣
反应程序:如果出现比目的条带大的杂带,可以缩短延伸时间,如果非特异性条带较小,可以提高退火温度。
4️⃣酶量过多:建议减少酶用量。



03


跑胶条带有弥散或拖尾 :

1️⃣胶:制胶时凝胶没有完全融化
2️⃣
模板及引物发生降解
3️⃣
酶:酶用量过多

这下原因算是搞清楚了,但没熟练的技术和完备的实验器材,2年也还是出不了结果不如赶紧找专业团队→3个月出实验结果,25年毕业/晋升都稳了~


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