结合医院高质量发展专家许伟明十几年来为各级医院提供培训咨询的实践经验发现，99%的医院绩效考核都有以下三大问题：
1.考核对象不合理。
只考核业务科室，不考核管理科室。
只考核中基层，不考核高层。
2.考核指标不合理。
对业务科室的考核，经济指标和质量指标所占权重过高，宣教指标、服务指标、市场指标、学科指标所占权重过低。使得业务科室重视结果不重视过程，不重视经济指标实现的过程，最终往往将经济指标没有达成的责任归咎于需求减少、医院平台不够、医疗技术不先进、科室设备不齐全等客观因素。
对管理科室的考核，缺少量化考核指标，多为定性考核，绩效工资没有跟科室的工作质量、数量进行挂钩。比如宣教部门没有考核粉丝量、点击量、发布量、原创量、活动量、渠道量、转发量、设计量，服务部门没有考核满意度、问题量、改善量、投诉量、复诊率、转化量。而且没有跟医院经济指标进行挂钩，比如门诊量、住院量、体检量，只对业务科室考核经济指标而不对管理科室考核经济指标，那么管理科室凭什么要拿业务科室的平均绩效？既然要拿，就要为医院的业务发展做出应有的贡献，就要去考核贡献了多少，总的原则是把医院经济发展跟每一个员工挂钩。
3.考核结果不分析
医院绩效考核部门对全院科室的绩效考核结果缺乏分析、改善环节，从而帮助科室提高绩效。毕竟考核的目的是为了提高绩效，因此考核部门就有必要有义务对考核结果进行应用。
