9.4/Q1,同济大学附属东方医院运用孟德尔探讨细胞因子与肌肉减少症和衰老特征的因果关系

文摘   2024-11-03 06:00   陕西  

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文章标题:Mapping the causal associations of cytokines with sarcopenia and aging traits: Evidence from bidirectional Mendelian randomization

中文标题:绘制细胞因子与肌肉减少症和衰老特征的因果关系:来自双向孟德尔随机化的证据

发表期刊J Cachexia Sarcopenia Muscle .

发表时间2024年6月

影响因子9.4/Q1

研究背景

由于细胞因子和生长因子在炎症中的作用,它们可以作为研究炎症和肌肉减少症之间因果关系的桥梁。在这项研究中,我们旨在探讨细胞因子与肌肉减少症和衰老特征的因果关系,并进一步确定重要的炎症因素。

究方法

采用双向孟德尔随机化 (MR) 分析确定因果关系。41 种循环细胞因子和生长因子被设置为暴露,数据来自一项全基因组关联研究 (GWAS),该研究包含三个队列,8293 年至 1983 年欧洲血统的健康参与者2011 名。选择手握力、调整后的附件瘦体重 (AALM)、通常的步行速度、中度至剧烈的体力活动 (MVPA) 水平、能够独立行走或骑自行车 10 分钟 (AWCU10) 和端粒长度作为结局。结局数据来自 meta-GWAS 和英国生物样本库,样本量从 69 537 到 472 174 不等。低手握力分别由欧洲老年人肌肉减少症工作组 (EWGSOP) 和美国国立卫生研究院基金会 (FNIH) 的临界点定义。根据英国生物样本库和原始队列的标准定义和测量其他结果特征。我们为与暴露相关的单核苷酸多态性 (SNP) 设置了两个显着性阈值,以获得足够的 SNP (5 × 10-6 和 5 × 10-8)。采用逆方差加权、MR-Egger 和加权中位数来估计因果关系。

结果分析

1. 主要分析 A

如图 2 A、B 所示,确定了六种细胞因子和生长因子与肌肉减少性状和端粒长度有关:CTACK(皮肤 T 细胞吸引趋化因子)、嗜酸性粒细胞趋化因子、IL16(白细胞介素-16)、IL18(白细胞介素-18)、MIP1b(巨噬细胞炎症蛋白 1b)和 PDGFbb(血小板衍生生长因子 BB)。据估计,CTACK 与 4 个肌肉减少症特征有因果关系:高血清 CTACK 水平与手握力差 (EWGSOP 和 FNIH) 有因果关系,独立行走或循环能力低 10 分钟和端粒长度差。在分析 A 中,CTACK 被证明是肌肉减少症的危险因素。与 CTACK 类似,MIP1b 也被估计与不良的肌肉减少性状有关,包括手握力差 (EWGSOP) 和 AWCU10。IL16 的因果效应是自相矛盾的:IL16 被证明是握力 (EWGSOP) 和 AWCU10 的保护因素,同时是 MVPA 的危险因素。

2. 主要分析 B

有关细胞因子和生长因子与肌肉减少症和衰老特征的因果关系的详细信息。与主分析 A 相比,发现更多的细胞因子和生长因子对肌肉减少症和衰老特征有因果影响。

3. 主要分析 B

IL16 与肌肉减少症和衰老特征的因果关联数量最多,但结果仍然是自相矛盾的。IL16 可能对握力和 AWCU10 有积极影响,同时对 AALM 有负面影响。此外,结果表明 PDGFbb 是 AALM 和端粒长度的保护因素,分析A也提出了PDGFbb的积极影响。与分析A的结果类似,高水平的CTACK与端粒长度差有因果关系,MIP1b也被证明是AWCU10的危险因素。

4. 肌肉组织表达分析

表 S19 总结了来自无肌肉减少症和有肌肉减少症的个体的肌肉组织的原始表达基质以及细胞因子和生长因子的基本信息和鉴定。将正常人群中细胞因子和生长因子对应的基因表达水平与肌肉减少症人群中的表达水平进行了比较,结果总结于表 S20 中。确定了患有和不患有肌肉减少症的个体肌肉组织中 12 种细胞因子和生长因子的不同表达水平(图 5)。

文章小结

27 个因素与肌肉减少症和衰老特征呈因果关系,IL16 、 CTACK 、 MIP1b 和 PDGFbb 的因果效应在两种分析中均以两个显著性阈值得到证实。如果您对生信分析和公共数据库挖掘感兴趣,但时间和精力有限或者缺乏相关经验,小骨非常乐意为您提供如下服务:免费思路评估、付费方案设计生信分析等,有意向的老师欢迎联系小骨哦!

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